La creación del Instituto de Educación Superior Tecnológico Público “El Dorado”, surge ante la necesidad de contar con una institución superior en la Provincia El Dorado.  Es así como el 17 de Julio del año 2000 un grupo numeroso de personas decidieron apostar por su pueblo, llegando a la constitución de un comité de creación del Instituto Superior Tecnológico en la Provincia El Dorado, conformado por ciudadanos decididos a trabajar por el engrandecimiento de su provincia: Dervith Reátegui Tuanama (presidente), Jorge Fernández Olivera (vice-presidente), Miguel Antonio Rodríguez Ríos (secretario de actas), Wilfredo Tapia Noriega (tesorero) y Cicerón Barrera Torres (vocal).

Finalmente, con resolución Ministerial Nº 0647 – 2004 – ED del 17 de diciembre del 2004, se crea el Instituto Superior Tecnológico Público “El Dorado” con el programa de estudios de Producción Agropecuaria. Asume las funciones el primer director encargado mediante Resolución Directoral Nº 0306 – 2005 - DRESM, el profesor William Guerra Valera, periodos 2005 – 2006. Luego mediante Resolución Nº 00109 - DRESAM se le asigna la dirección al Ing. Hernán Díaz Agip, periodos 2007 – 2008. Y a inicios del año 2009, con RD N° 0916-2009, el Prof. Kennedy Vela Jorge, períodos 2009 – 2012.

Después de una etapa de funcionamiento y evaluación de la gestión del instituto que no cumplió con los objetivos y metas trazadas, cambia el rumbo del IESTP. La Dirección Regional de Educación de San Martín y la Congregación de Hermanas Mercedarias de la Caridad para dar una respuesta a la urgencia educativa de la época creada por la coyuntura negativa de una deficiente gestión, el Estado y la Congregación firman un Convenio con fecha 22/02/2013, convirtiéndose en una Institución de Acción Conjunta para toda gestión (movimiento de plazas, personal, y otros). Dicho convenio se sostiene según el Concordato Estado - Vaticano (DL 23211 del 19/07/80) y Reglamentos de Acción Conjunta aprobado con RM N° 483-89-ED. 

La nueva gestión marcada por el convenio resulta positiva dado el modelo organizacional de la Congregación de hermanas Mercedarias de la Caridad, que designa para la Dirección del instituto a la Hna. Elsa Melita Mendoza Nájar MC. Durante el periodo 2013-2014. Le sucede la Hna. Manuela Antonia Reátegui Cabrera, MC. Durante la etapa 2015-2019, para luego retomar la dirección la Hna. Elsa Melita Mendoza Nájar, MC. Durante el periodo que estuvo marcado por la pandemia en el año 2020 hasta 2021 en el que es víctima mortal de la COVID-19. La congregación ve necesario proponer un personal laico que asuma las funciones de dirección, que recae sobre el economista Jesús de Jesús Huamán Mena hasta el año 2023. En la actualidad asume la Dirección la Hna. Rosario More Flores, MC.

La institución se incorporó a partir del año 2010 al nuevo Diseño Curricular Básico mediante el sistema Modular, consolidando la formación profesional de los estudiantes con el enfoque por competencias y el desarrollo de capacidades emprendedoras en gestión empresarial e innovación tecnológica. Actualmente, se propone un nuevo plan de estudios para el programa de Producción Agropecuaria, elaborado según el requerimiento y la demanda del sector empresarial y productivo de la provincia, y en consecuencia, de la Región San Martín consolidando de esta manera el proceso de licenciamiento que nos permitirá incorporar nuevos programas de estudios.